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2019.4

por Edson Luiz Folador publicado 24/02/2021 15h19, última modificação 24/02/2021 15h20
Identificação e validação in silico de proteínas essenciais de Corynebacterium ulcerans como potenciais alvos para fármacos: Estudo de caso com derivados de alcalóides tetraisoquinolínicos. por Edson Luiz Folador — última modificação 24/02/2021 15h20

Com o avanço e utilização das técnicas de alto rendimento uma enorme quantidade de interações proteína-proteína estão disponíveis em diversos bancos de dados. Interações proteína-proteína são importantes pois permitem determinar se uma proteína é essencial para a manutenção da vida de um organismo. Identificar dentre as proteínas de um organismo quais lhe são essenciais é importante para diversas aplicações, como o desenvolvimento de fármacos. Procuramos neste trabalho, pelo método de interolog mapping, predizer a rede de interação proteína-proteína visando identificar e validar a essencialidade das proteínas hub de Corynebacterium ulcerans, sugerindo assim o seu uso como novos alvos para candidatos a drogas. O microrganismo em questão é uma das bactérias causadoras da difteria com maior potencial mutagênico, por ter como hospedeiros não só humano como também animais e por conta da difteria se manter endêmica em países como Índia e Venezuela. Identificamos 457 proteínas hub na rede de C. ulcerans e destas 421 (92,12%) tiveram essencialidade comprovada e 36 (7,88%) consideradas essenciais após análises funcionais e de enriquecimento. Com o potencial de serem utilizadas como alvo para drogas, tivemos 351 (76,8%) proteínas hub sem homologia com H. sapiens. Dentre estas 99 (21,66%) tiveram estrutura tridimensional predita, validada e com pockets drogáveis, viáveis para docking. No estudo de caso com as proteínas alvo dentre 42 derivados sintéticos de alcalóides tetrahidroisoquinolínicos foram identificados os seis mais promissores para serem usados como droga. Palavras chaves: Corynebacterium ulcerans; interolog mapping; rede de interação proteína-proteína; proteínas essenciais; docking molecular; alcalóides tetrahidroisoquinolínicos; candidatos a droga;