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ANÁLISE GENÔMICA E METABOLÔMICA DE UMA LINHAGEM DE STREPTOMYCES GALBUS ISOLADA DO SEMIÁRIDO PARAIBANO

por Edson Luiz Folador última modificação 25/02/2021 16h35
A resistência antimicrobiana vem alertando entidades governamentais e a Organização Mundial da Saúde (OMS) com uma iminente crise global provocada pelo aumento gradativo da ineficácia de antibióticos frente a patógenos multirresistentes. As actinobactérias têm sido a maior fonte dos antibióticos utilizados clinicamente. Membros desse filo estão presentes em vários ambientes, inclusive, ambientes considerados extremos (como o bioma Caatinga), os quais têm sido o foco de exploração de novos antibióticos. Com isso, modernas abordagens começam a ser adotadas, em adição da exploração desses ambientes inexplorados. Entre eles, o sequenciamento genético juntamente com a aplicação de ferramentas da bioinformática na mineração de genomas tem ajudado a conhecer a diversidade de bactérias e os metabólitos secundários que estas produzem. Como também, métodos analíticos como cromatografia associada a espectrometria de massas para análises de extratos têm surgido como formas de mudar o panorama frente à pesquisa de novas moléculas com potencial antibiótico. Nesse estudo, uma linhagem de actinomiceto isolado na região do Cariri paraíbano que apresenta uma excelente atividade antimicrobiana e antitumoral, teve seu genoma sequenciado, anotado e estimado in silico quanto à produção de metabólitos secundários de interesse. A partir de análises genômicas, o isolado apresenta tamanho do genoma de 7 548 406 pares de bases e um alto conteúdo de guanina e citosina de 73,16%. Com análises filogenéticas, a linhagem I339 foi classificada como pertencente à espécie Streptomyces galbus e mostrou uma relação íntima com a S. galbus DSM 40089 e um distanciamento com a S. longwoodensis DSM 41677, a qual pôde ser visualizada através de análises de genômica comparativa entre as espécies. A análise de agrupamentos de genes relacionados a síntese de metabólitos mostrou a presença de 47 agrupamentos para S. galbus I339, sendo alguns destes, relacionados à produção de moléculas com atividade antimicrobiana e antitumoral. Através de análises de cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas (GC-MS) e por ionização em eletrospray seguido de espectrometria de massas (ESIToF-MS) foram identificados compostos com potencial antimicrobiano e anticancerígeno como as dicetopiperazinas e o grupo das actinomicinas. Além do mais, foram identificadas diversas massas que não puderam ser associados a compostos já descritos, os quais podem estar relacionadas a novas moléculas. As predições in silico associadas aos métodos de análise físico-química demonstram uma notável capacidade da linhagem I339 de S. galbus para a produção de metabólitos secundários, sendo uma grande candidata a produção de novas moléculas com propriedades antibióticas. Palavras-chave: Resistência antimicrobiana. Actinobactéria. Metabólitos secundários. Desreplicação. Mineração de genomas.